根據(jù)滬文管發(fā)[2008]349號(hào)文，上海水產(chǎn)大學(xué)鯨館經(jīng)上海市文物管理委員會(huì)同意，正式更名為上海海洋大學(xué)博物館。在校領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)心、支持下，上海水產(chǎn)大學(xué)鯨館自成立以來，已累計(jì)接待十萬余名海內(nèi)外參觀者，社會(huì)影響日益擴(kuò)大，有效發(fā)揮了上海水生生物科普教育基地的功能，為發(fā)展上?？破帐聵I(yè)，傳承民族文化，塑造學(xué)校形象作出了貢獻(xiàn)。2005年水產(chǎn)大學(xué)鯨館被上海市科教黨委批準(zhǔn)列為上海高校民族文化博物館之一。

    因5月6日上海水產(chǎn)大學(xué)正式更名為上海海洋大學(xué)，“上海水產(chǎn)大學(xué)鯨館”名稱已不適用。同時(shí)，為便于內(nèi)涵發(fā)展需要，經(jīng)主管校領(lǐng)導(dǎo)同意，報(bào)請(qǐng)上海市文物管理委員會(huì)批準(zhǔn)，上海水產(chǎn)大學(xué)鯨館更名為上海海洋大學(xué)博物館，下設(shè)鯨館、上海水生生物科技館等。